Начальная инициализация "динамических" структур. как обычно это делается?

ну так делайте как хотите, зачем тогда спрашивать?
Я не вижу, чем это уточнение не согласуется с моим ответом.
Во всех предложенных вариантах функции вполне смогут обращаться к массивам как элементам структуры.

 

Вы, по-моему, спрашивали. "как обычно делают".?
Так вот, создавать отдельно массивы и отдельно структуры со ссылками на них имеет смысл только тогда. когда число массивов не равно числу структур (например, есть один общий массив. а все структуры ссылаются на него).
Если же у вас для каждого экземпляра структуры свой массив - то отдельно такое никто не создает, тогда пишет особый метод - конструктор, который одновременно создают структуру и динамический массив, указатель на который присвается члену структуры.

 

пример структуры с динамическим массивом и конструктором

Код (C++):

//структура 0
typedef struct {
    int32_t   cnums;       //количество входов
    float    * in;       // указатель на массив
 
    ELEMENT (int32_t nums) {     // конструктор с созданием массива размером nums
      this->cnums = nums;
      this->in = (float*)malloc(nums*sizeof(float));
}
} ELEMENT;

 

Что говорить! Такого не делал. Попробую. Спасибо!!!!!

 

добавление к

Но такое по моему есть в http://forum.amperka.ru/attachments/devcpp_4-pdf.24668/?temp_hash=f47c58097744235aa6bf0d95f781e310

 

Может и есть, это ж стандартная конструкция языка.
Хотя эта книжка вообще не об этом

 

Вопрос не решил пока, но по ходу стал курить и make:
вот рабочий набросок Makefile:

Код (Text):

CC    := gcc
LD    := gcc
CFLAGS    := -c -Wall -v
LDFLAGS    := -lm

INC    := -I$(PWD)/neuro
.DEFAULT_GOAL    := warn            #если "make" без параметра

# ---- test1 - тестовая программа при разработке ----
# тест формирования структур
CFLAGS    :=-c -Wall
Test1OBJ    =     out/test1.o \
            out/neuro.o \
            out/activate.o
test1: $(Test1OBJ)
    $(LD) $(LDFLAGS) $(Test1OBJ) -o out/test1

#--- testshm - тестовая программа доступа к разделяемой памяти ---
TestShmOBJ        =     out/testshm.o
testshm: $(TestShm)
    $(LD) $(LDFLAGS) $(TestShm) -o out/testshm
#-- testfctivate - тестовая программа проверки функции активации ---
TestFActivateOBJ    =    out/testfactivate.o \
                out/activate.o
testfactivate: $(TestFActivateOBJ)
    $(LD) $(LDFLAGS) $(TestFActivateOBJ) -o out/testfactivate
    @rm -rf out/*o
    @cp scripts/testfactivate.sh  out/testfactivate.sh
    @chmod +x out/testfactivate.sh
#---------------------------
out/testfactivate.o:
    $(CC) $(CFLAGS) $(INC) test/testfactivate.c -o out/testfactivate.o
out/testshm.o:
    $(CC) $(CFLAGS) $(INC) test/testshm.c -o out/testshm.o
out/test1.o:
    $(CC) $(CFLAGS) $(INC) test/test1.c -o out/test1.o
out/neuro.o:
    $(CC) $(CFLAGS) $(INC) neuro/neuro.c -o out/neuro.o
out/activate.o:
    $(CC) $(CFLAGS) $(INC) neuro/activate.c -o out/activate.o

# очистка
clean:
    rm -rf out/*o
    rm -rf out/test1
    rm -rf out/testshm
    rm -rf out/testfactivate

#полная очистка
fclean:
    rm -rf out/*

# подсказка
help:
    @echo "*************************************************************"
    @echo "help          - текущая подсказка"
    @echo "testfactivate - проверка функции(й) активации"
    @echo "testshm       - проверка доступа к разделяемой памяти"
    @echo "test1         - сборка теста"
    @echo "*************************************************************"

# запуск без параметров
warn:
    @echo "воспользуйтесь параметром \"help\" для информации (введите \"make help\")"