Подскажите, такая схема соединения не опасна для малины? В момент старта Arduino, когда ее пины еще не проинициализированы не возникает ли на ее нулевом пине 5В, которые могут быть опасны малине?
5В на нулевом пине возникнуть не может никак. На то он и нулевой. Вы основ не понимаете. Напряжение это разница потенциалов между двумя точками. И в данном случае оно измеряется относительно нулевого пина, то есть сравнивается потенциал на одной и той же точке. Если блоки гальванически развязаны от сети, а других вы не найдете, то угрозу представляет только заряд на них до подключения (статическое электричество)
Не забывайте, что на 3 малине на пины выведен софтварный UART, который косячит, когда частота процессора переключается.
Почему-то Arduino Mega перезагружается, когда с ней связь устанавливается по USB. эта неприятная фишка зовется AutoResetOnSerialConnection. У меня в роботе 2-я малина, с ней такой проблемы нет?
Если вас обосновано беспокоит состояние пинов малинки, рекомендую делать все-таки так: http://www.chipdip.ru/product/adum1201brz/ Даже проще и лучше чем оптопары