avrdude: ser_open(): can't open device "\\.\COM3": Не удается найти указанный файл.

ну правильно. Но если вы одну плату отключили и воткнули другую, то , к примеру, порт COM8 у вас в системе пропал, а COM12 появился - и Ардуина ИДЕ автоматически выберет COM12. разве не так?

 

Не проверял, во время 1 сеанса платы не менял.

 

Ну а если выйти из ИДЕ и потом снова войти - тем более должен искать новый порт, а не подключаться к старому, которого нет.